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| 記録順位 | No | 氏名 | 所属 | 資格記録 |
| 1 | 754 | 杉本 明洋 (M2) | 京都大 ・愛 知 | 41:41.3 |
| 2 | 120 | 堀井 重利 ( 2) | 中京大 ・静 岡 | 43:00.4 |
| 3 | 278 | 北村 裕規 ( 3) | 広島大 ・大 阪 | 44:06.4 |
| 4 | 103 | 大坪 鷹人 ( 3) | 中京大 ・愛 知 | 44:48.6 |
| 5 | 768 | 磯谷 昇太 ( 1) | 京都教育大 ・長 崎 | 45:53.8 |
| 6 | 981 | 表 知徳 ( 4) | 立命館大 ・石 川 | 46:20.2 |
| 7 | 342 | 泉 明宏 ( 3) | 松山大 ・愛 媛 | 48:54.1 |
| 8 | 763 | 廣江 悠 ( 1) | 京都大 ・奈 良 | 48:59.9 |
| 9 | 347 | 月輪 浩之 ( 3) | 美作大 ・島 根 | 49:08.5 |
| 10 | 711 | 八木 圭 ( 1) | 関西外語大 ・兵 庫 | 49:09.3 |
| 11 | 456 | 柿本 寛透 ( 1) | 志學館大 ・熊 本 | 50:16.1 |
| 12 | 984 | 熊野 仁 ( 3) | 立命館大 ・石 川 | 50:40.1 |
| 13 | 424 | 進藤 誠也 ( 2) | 九州情報大 ・佐 賀 | 51:21.5 |
| 14 | 435 | 鮫島 大吾 ( 1) | 九州情報大 ・鹿児島 | 53:17.1 |
| 15 | 1029 | 網本 雄介 ( 1) | 龍谷大 ・香 川 | 53:39.7 |
| 16 | 213 | 生信 貴至 ( 2) | 岡山商大 ・岡 山 | 54:00.0 |
| 17 | 65 | 廣田 拓也 ( 1) | 岐阜経済大 ・岐 阜 | 54:11.4 |
| 18 | 851 | 古峨 能喜 ( 2) | 神戸大 ・兵 庫 | 55:20.0 |
| 19 | 818 | 合田 耕二 ( 3) | 近畿大 ・大 阪 | 55:22.3 |
| 20 | 266 | 矢野 喜一 ( 1) | 徳山大 ・大 分 | 23:39.2 |
| 21 | 887 | 藤林 宏彰 ( 1) | 太成学院大 ・大 阪 | 23:42.6 |