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| 記録順位 | No | 氏名 | 所属 | 資格記録 |
| 1 | 263 | 横山 雅彦 (M2) | 徳島大 ・徳 島 | 47.14 |
| 2 | 815 | 岸田 博樹 ( 3) | 近畿大 ・兵 庫 | 47.15 |
| 3 | 824 | 上北 恵士 ( 2) | 近畿大 ・大 阪 | 47.20 |
| 4 | 685 | 原田 洵志 ( 2) | 関西大 ・岡 山 | 47.49 |
| 5 | 925 | 芦田 博貴 ( 2) | 同志社大 ・兵 庫 | 47.53 |
| 6 | 792 | 田中 誠 ( 2) | 京都産業大 ・京 都 | 47.55 |
| 6 | 1000 | 金普@広治 ( 1) | 立命館大 ・滋 賀 | 47.55 |
| 8 | 771 | 北岡 智識 ( 4) | 京都産業大 ・三 重 | 47.63 |
| 9 | 124 | 小林 祐太 ( 2) | 中京大 ・奈 良 | 47.85 |
| 9 | 670 | 濱 貴博 ( 4) | 関西大 ・京 都 | 47.85 |
| 11 | 457 | 鈴木 諒 ( 1) | 志學館大 ・宮 崎 | 47.86 |
| 12 | 462 | 奥 博志 ( 2) | 長崎大 ・福 岡 | 47.87 |
| 13 | 131 | 可知 晃徳 ( 4) | 名古屋大 ・愛 知 | 47.93 |
| 14 | 316 | 黍野 貴大 ( 4) | 広島修大 ・広 島 | 47.98 |
| 15 | 525 | 浅井 遼介 (M1) | 福岡教育大 ・大 分 | 48.07 |
| 15 | 744 | 山口 恭平 ( 1) | 関西学院大 ・兵 庫 | 48.07 |
| 17 | 356 | 村谷 康孝 ( 3) | 山口大 ・山 口 | 48.10 |
| 18 | 510 | 藤本 健士郎( 1) | 福岡大 ・熊 本 | 48.11 |
| 19 | 434 | 大島 勇樹 ( 1) | 九州情報大 ・福 岡 | 48.12 |
| 19 | 612 | 稲見 拓也 ( 3) | 大阪体育大 ・東 京 | 48.12 |
| 21 | 407 | 坂田 敦 (M1) | 九州大 ・大 分 | 48.15 |
| 22 | 338 | 一色 啓旦 ( 3) | 松山大 ・愛 媛 | 48.18 |
| 23 | 488 | 永田 裕一 ( 3) | 福岡大 ・福 岡 | 48.22 |
| 24 | 110 | 柴田 健一 ( 2) | 中京大 ・愛 知 | 48.29 |
| 24 | 915 | 小野 高歩 ( 4) | 同志社大 ・京 都 | 48.29 |
| 26 | 702 | 夏原 知之 ( 3) | 関西外語大 ・滋 賀 | 48.32 |
| 27 | 1021 | 長谷川 雄也( 2) | 龍谷大 ・大 阪 | 48.36 |
| 28 | 819 | 高田 真吾 ( 2) | 近畿大 ・滋 賀 | 48.44 |
| 28 | 853 | 吉岡 幹記 ( 2) | 神戸大 ・兵 庫 | 48.44 |
| 30 | 206 | 梶原 大資 ( 1) | 岡山商大 ・岡 山 | 48.45 |
| 31 | 774 | 曾布川 航 ( 4) | 京都産業大 ・静 岡 | 48.48 |
| 32 | 20 | 東 哲久 ( 2) | 愛知学院大 ・愛 知 | 48.51 |
| 33 | 373 | 住吉 政彦 ( 4) | 鹿屋体育大 ・広 島 | 48.53 |
| 34 | 888 | 中本 喜己 ( 4) | 天理大 ・滋 賀 | 48.60 |
| 35 | 68 | 村田 大樹 ( 1) | 岐阜経済大 ・岐 阜 | 48.61 |
| 36 | 33 | 磯部 慶 ( 1) | 愛知教育大 ・愛 知 | 48.64 |
| 36 | 47 | 山田 祥太 ( 4) | 岐阜経済大 ・岐 阜 | 48.64 |
| 38 | 729 | 越智 啓介 ( 2) | 関西学院大 ・兵 庫 | 48.67 |
| 39 | 305 | 吉原 賢一 ( 1) | 広島経大 ・島 根 | 48.73 |
| 40 | 757 | 花谷 直人 (M2) | 京都大 ・奈 良 | 48.74 |
| 41 | 912 | 久保西 崇雄( 1) | 天理大 ・奈 良 | 48.76 |
| 41 | 962 | 竹内 祐一郎( 3) | 佛教大 ・埼 玉 | 48.76 |
| 43 | 223 | 大塚 直裕 (M1) | 香川大 ・香 川 | 48.78 |
| 44 | 707 | 上芝 優一郎( 2) | 関西外語大 ・奈 良 | 48.79 |
| 45 | 211 | 鳥越 翔 ( 1) | 岡山商大 ・岡 山 | 48.87 |
| 45 | 285 | 梶屋 允志 ( 3) | 広島大 ・広 島 | 48.87 |
| 45 | 665 | 兵庫 顕 ( 4) | 関西大 ・山 形 | 48.87 |
| 48 | 284 | 田口 雅典 ( 3) | 広島大 ・岡 山 | 48.92 |
| 49 | 224 | 中多 陽集 ( 1) | 香川大 ・香 川 | 48.96 |
| 50 | 703 | 佐久 恭英 ( 3) | 関西外語大 ・京 都 | 48.97 |
| 51 | 994 | 丹田 元気 ( 2) | 立命館大 ・大 阪 | 49.01 |
| 52 | 897 | 開田 剛史 ( 3) | 天理大 ・京 都 | 49.03 |
| 53 | 75 | 竹林 正人 ( 2) | 皇學館大 ・三 重 | 49.10 |
| 54 | 926 | 佐々木 智幸( 2) | 同志社大 ・青 森 | 49.26 |
| 55 | 265 | 和田 隆宏 ( 2) | 徳島大 ・徳 島 | 49.32 |
| 56 | 659 | 岡本 真 ( 3) | 大阪府立大 ・和歌山 | 49.45 |
| 57 | 833 | 清水 拓真 ( 3) | 甲南大 ・兵 庫 | 49.49 |
| 58 | 294 | 志賀 雄一郎( 4) | 広島経大 ・熊 本 | 49.54 |
| 59 | 876 | 川崎 一樹 ( 3) | 太成学院大 ・大 阪 | 49.56 |
| 60 | 613 | 内海 和宣 ( 3) | 大阪体育大 ・兵 庫 | 49.68 |
| 61 | 441 | 篠原 竜一 ( 2) | 熊本大 ・佐 賀 | 49.69 |
| 62 | 450 | 古田 勇樹 ( 4) | 志學館大 ・鹿児島 | 49.75 |
| 63 | 192 | 石井 寿和 ( 4) | 岡山大 ・岡 山 | 49.77 |
| 64 | 129 | 緑川 麿 ( 4) | 名古屋大 ・愛 知 | 49.81 |
| 65 | 13 | 河合 輝久 ( 4) | 愛知学院大 ・愛 知 | 49.86 |
| 65 | 317 | 久保田 基樹( 1) | 広島修大 ・広 島 | 49.86 |
| 67 | 805 | 藤井 大輔 ( 1) | 京都薬科大 ・大 阪 | 49.93 |
| 68 | 408 | 横溝 孝明 (M1) | 九州大 ・福 岡 | 50.01 |
| 69 | 209 | 八谷 啓夢 ( 2) | 岡山商大 ・岡 山 | 50.04 |
| 70 | 243 | 末田 里木 ( 4) | 高知工大 ・高 知 | 50.18 |
| 71 | 149 | 石倉 俊彦 ( 3) | 浜松大 ・愛 知 | 50.19 |
| 72 | 42 | 市川 裕之 ( 3) | 岐阜大 ・岐 阜 | 50.24 |
| 73 | 603 | 杉本 達郎 ( 3) | 大阪商業大 ・大 阪 | 50.28 |
| 74 | 339 | 大西 純平 ( 4) | 松山大 ・愛 媛 | 50.38 |
| 75 | 976 | 奥 貴博 ( 1) | 桃山学院大 ・和歌山 | 50.42 |
| 76 | 29 | 桃野 修太郎( 2) | 愛知教育大 ・愛 知 | 50.44 |
| 77 | 760 | 高瀬 雄一郎( 2) | 京都大 ・京 都 | 50.47 |
| 78 | 428 | 久保田 祐介( 2) | 九州情報大 ・福 岡 | 50.52 |
| 79 | 10 | 中馬 恭平 ( 1) | 愛知大 ・愛 知 | 50.54 |
| 80 | 54 | 天野 隼 ( 2) | 岐阜経済大 ・岐 阜 | 50.56 |
| 81 | 606 | 田中 躍平 ( 3) | 大阪市立大 ・大 阪 | 50.66 |
| 82 | 255 | 新山 好和 ( 3) | 島根大 ・島 根 | 50.69 |
| 83 | 1040 | 西田 裕 ( 3) | 和歌山大 ・和歌山 | 50.71 |
| 84 | 1027 | 安東 りん ( 2) | 龍谷大 ・大 阪 | 50.75 |
| 85 | 231 | 菊本 晃司 ( 2) | 倉敷芸大 ・岡 山 | 50.77 |
| 86 | 116 | 大菊 紳也 ( 2) | 中京大 ・愛 知 | 50.80 |