| 順位 | 学校名 | 総合得点 | 男子１部 １００ｍ | 男子１部 ２００ｍ | 男子１部 ４００ｍ | 男子１部 ８００ｍ | 男子１部 １５００ｍ | 男子１部 ５０００ｍ | 男子１部 １００００ｍ | 男子１部 ハーフマラソン | 男子１部 １１０ｍＨ | 男子１部 ４００ｍＨ | 男子１部 ３０００ｍＳＣ | 男子１部 １００００ｍＷ | 男子１部 ４×１００ｍ | 男子１部 ４×４００ｍ |
| 1 | 関西学院大 | 129 | 13 | 19 | 4 | 8 | 14 | 3 | 15 | 11 | 12 | 12 | 4 | 8 | 6 | |
| 2 | 立命館大 | 70 | 2 | 1 | 3 | 12 | 9 | 18 | *13 | 3 | 2 | 4 | 3 | |||
| 3 | 大阪体育大 | 50 | 10 | 1 | 8 | 6 | 4 | 3 | 7 | 6 | 5 | |||||
| 4 | 関西大 | 48 | 7 | 10 | 6 | 7 | 5 | 2 | 7 | 4 | ||||||
| 5 | 近畿大 | 40 | 5 | 2 | 8 | 9 | 3 | 5 | 8 | |||||||
| 6 | びわスポ大 | 39 | 7 | 4 | 6 | 4 | 16 | 2 | ||||||||
| 7 | 大阪教育大 | 34 | 4 | 8 | 4 | 8 | 1 | 2 | 7 | |||||||
| 8 | 龍谷大 | 34 | 3 | 4 | 14 | 13 | ||||||||||
| 9 | 京都産業大 | 33 | 1 | 12 | 13 | 3 | 4 | |||||||||
| 10 | 同志社大 | 33 | 3 | 3 | 7 | *12 | 6 | 1 | 1 | |||||||
| 11 | 京都教育大 | 4 | 1 | 3 |